由於香港淡水資源缺乏,水務署自1958年開始引入鹹水(即海水)作沖廁及部分消防用途,以減少淡水的消耗,至今是世界上廣泛使用海水沖廁的少數地區之一。到2015年,海水供應網絡已覆蓋香港達八成半人口,每年節省約2億8,000萬立方米的淡水,相等於香港約兩成的總水用量[63]。2001年,香港海水沖廁系統曾獲英國水務及環境管理學會頒發「Chris Binnie 持續水務管理大獎」,此獎項表揚一些改善水資源的可持續性,並且造福社會的項目、政策或研究。
在海水沖廁系統設立初期,香港曾建有如佐敦谷水塘及馬游塘水塘等露天的鹹水水塘。鹹水的供應範圍最初限於政府及政府補助的高密度住宅,其後擴展至市區及新市鎮。系統起初不受歡迎,因為每棟樓宇必須另建管道才能配合系統運作。自1972年起,海水改為免費提供,當局透過徵收水費收回系統成本。至1991年,香港使用海水沖廁率約百分之65;至2014年達約百分之80[67];至2015年,隨著新界西北海水供水系統投入運作,普及率達到百分之85;而海水供應網絡下一步將會擴展到位於大嶼山的東涌[68]。海水沖廁的海水是免費供應;淡水沖廁的水費則每4個月結算一次,不過首30立方米用水免費